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RNAseq de novo assembly (Illumina platform) RNAseq de novo assembly (Illumina platform) 분석은 표준 유전자 서열이 밝혀지지 않은 생물의 RNA 를 통해 short-read 기반의 sequencing data를 생산하고, 이를 이용해 표준 유전자 서열을 조립하는 분석입니다. Raw read를 정렬하고 조립하여 유전자로 재구성함을 통해 표준 유전자 서열을 확보할 수 있습니다. 사용된 short-read 기반의 sequencing data를 확보된 표준 유전자 서열에 alignment하여 유전자의 발현량 분석을 진행할 수도 있습니다. 자세히 보기

RNAseq de novo assembly (Pacbio platform Iso-Seq.) RNAseq de novo assembly (PacBio platform Iso-Seq.) 분석은 표준 유전자 서열이 밝혀지지 않은 생물의 RNA 를 통해 long-read 기반의 sequencing data를 생산하고, 이를 통해 별도의 assembly 과정 없이 표준 유전자 서열을 확보할 수 있습니다. Pacbio platform Iso-Seq.을 통한 표준 유전자 서열은 다양한 alternative splice form 을 확보할 수 있고, full length 유전자 서열을 얻을 수 있는 장점이 있습니다. PacBio platform 기반의 분석 파이프라인을 따라 진행됩니다. 자세히 보기

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