KEGG analysis
KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)는 생화학 Pathway 관련 데이터베이스로, 해당 분석을 통해 Functional annotation을 얻을 수 있습니다. 대상 유전자들을 KEGG DB와 비교하여 유전자들이 어느 Pathway에 관여하는지 결과를 얻을 수 있습니다.
또한 관심있는 Pathway의 어느 단계에서 유전자의 발현이 변화되는지 KEGGmapper나 MAPMAN과 같은 프로그램을 통해 Visualization 할 수 있으며, 통계적인 방법을 통해 P-value 값에 따라 유의하다고 판단되는 Pathway를 Plot으로 표현할 수 있습니다.
또한 관심있는 Pathway의 어느 단계에서 유전자의 발현이 변화되는지 KEGGmapper나 MAPMAN과 같은 프로그램을 통해 Visualization 할 수 있으며, 통계적인 방법을 통해 P-value 값에 따라 유의하다고 판단되는 Pathway를 Plot으로 표현할 수 있습니다.
Work Flow
Result Examples
KEGG 분석 결과
결과 Visualization
관련 분석사례
총 74건- 나노클로롭시스 RNAseq data를 이용한 질소처리 유무 관련 DEG 분석
- 나노클로롭시스 RNAseq의 WT-MT 간 질소처리에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 벼 RNAseq의 이앙 전 후 지상부와 뿌리 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 당귀 RNAseq의 화색 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 사과 RNAseq의 품종의 개화 시기에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 에뜰리아 RNAseq의 저온/고온 처리에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 고추 RNAseq의 복함감염 및 병원성 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 시금치 RNAseq의 de novo assembly 및 곤충 가해 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 갯장대 RNAseq의 de novo assembly 및 애기장대/갯장대의 salt stress 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 감귤 RNAseq의 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 토마토 RNAseq의 감마선에 의한 돌연변이 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 에뜰리아 RNAseq의 독립/종속 영양 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 클로렐라소르키니아나 RNAseq의 de novo assembly 및 이산화탄소 처리에 의해 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 동부콩 RNAseq의 감마선/양성자 처리에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 시네코시스티스 RNAseq의 WT-MT 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 나노클로롭시스 RNAseq의 WT-MT 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 감자 RNAseq의 de novo assembly 및 재분화 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 배추 뿌리혹병 관련 RNAseq의 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 구상나무 RNAseq의 de novo assembly 및 건조 처리 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- Microcystis aeruginosa KW RNAseq의 KEGG 분석 결과 visualization
- 구상나무 RNAseq의 de novo assembly 및 열 처리 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 포플러 RNAseq의 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 들깨 RNAseq의 mutant에서의 IK유전자 발현 분석
- 프리지아 RNAseq의 이병성/저항성 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 애기장대 RNAseq의 방사선 처리에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 만가닥버섯 RNAseq의 조직 내 발달단계 별 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 클라미도모나스 RNAseq의 과산화수소 처리 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 클라미도모나스 RNAseq의 색소체 변이 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 클라미도모나스 RNAseq의 방사선 저항성 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 케나프 RNAseq의 화색이 다른 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 배추 RNAseq의 색 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 갯무 RNAseq의 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 유색고약버섯 RNAseq의 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 표고버섯 RNAseq의 조직별, 품종별 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 단감 RNAseq의 개화 후 시간 흐름에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 애멸구 RNAseq의 발달단계 별 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 벼 RNAseq의 침관수 처리에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 무 RNAseq의 저온 처리에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 클로렐라 RNAseq의 변이체 유무에 따른 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 배추 RNAseq의 감염처리 유무에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 사상성 진균(Cryphonectria parasitica) RNAseq의 wild type과 바이러스처리 및 돌연변이 6종 발현량 분석
- 표고버섯 RNAseq의 돌연변이 유무에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 프리지아 RNAseq의 정상화/기형화 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 토마토 RNAseq의 음파 처리에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 감귤 RNAseq의 과실, 과피의 성숙단계 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 참취, Insect Larva RNAseq의 de novo assembly 및 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 콩 RNAseq의 wound stress에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 방울토마토 RNAseq의 바이러스 처리 유무에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 애기장대 RNAseq의 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 표고버섯 RNAseq의 de novo assembly 및 균사체/자실체 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 밀 RNAseq의 종자발달 단계에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 금강밀 RNAseq의 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 나노클로롭시스 RNAseq의 de novo assembly 및 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 뱀장어 RNAseq의 de novo assembly 및 섭취 사료 종류에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 겨울우산버섯 RNAseq의 Mg처리량 및 처리시기에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 단감 RNAseq의 de novo assembly 및 수확 후 시기에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 표고버섯 RNAseq의 WT-MT 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 국화 RNAseq의 병저항성 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 무 RNAseq의 개화시기 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 미세조류(Dunaliella) RNAseq의 wavelength 별 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 배 RNAseq의 질병 처리에 따라 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 참외 RNAseq의 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 오이 RNAseq의 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 돼지감자 RNAseq의 de novo assembly 및 품종 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 감자 RNAseq의 안토시아닌 생합성 관련 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 포도 RNAseq의 GA처리 및 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 약용작물(지황) RNAseq의 de novo assembly 및 샘플 및 조직 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 약용작물(까마중) RNAseq의 de novo assembly 및 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 약용작물(황기) RNAseq의 de novo assembly 및 샘플 및 조직 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 번행초 RNAseq의 de novo assembly 및 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 양배추 RNAseq의 de novo assembly 및 품종 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 케일 RNAseq의 de novo assembly 및 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 인삼 RNAseq의 de novo assembly 및 샘플 간 유의하게 발현하는 유전자 분석
- 엉겅퀴 RNAseq의 de novo assembly 및 annotation